Das HIS-Institut für Hochschulentwicklung unterhält zu diversen Einrichtungen und Institutionen kooperative Partnerschaften, u. a.:

• Allianz der deutschen Wissenschaftsorganisationen (Schwerpunktinitiative "Digitale Information")

• Arbeitskreis Prüfungsverwaltung

• Arbeitskreise der Universitätskanzler

• Gesellschaft für Medien in der Wissenschaft

• Hochschulforum Digitalisierung

• Nachfolgeeinrichtungen der HIS GmbH